太陽的核心是一個温度高达 1500 萬開爾文的超高温熔炉。核反應產生的巨大能量從核心向外傳播，温度逐漸降低，到太陽表面時，温度已經降至只有 5800 開爾文了。然而，科學家在太陽表面的外部發現了一個奇怪的現象：随着與太陽表面的距離增加，温度反而升高了。日冕是太陽外部范围广泛的等離子體结构，其密度仅为光球层的 1/10^12，但測量結果顯示其温度竟可達 100 萬至 300 萬開爾文！色球層和日冕之間，有一個厚度从十公里到几百公里的 “過渡區”，温度正是在这里突然升高。從熱力學角度來說，很难解釋這樣一種現象，就好像一個電灯泡竟能把周圍的空氣加熱到比電灯泡還熱。一為此，必須寻找非熱力學的加熱机制。
幾十年來，科學家提出了許多日冕加熱理論，目前被廣泛接受的有声波致熱和磁重連兩種理論。声波致热理論是在 1949 年提出的。太陽是一種充斥着磁場的高温等離子體，因此描述磁場中等離子體波動現象的磁声波和阿爾文波被認為是太陽最重要的波動模式。太陽光球上，米粒組織或超米粒組織的擾動都会產生這兩種波，它們都能攜帶能量，穿越太陽外部大氣层，最终以激波的形式将能量转化為熱能。
另一种可能的加熱机制是磁重連理論。太陽磁場在日冕中引發電流，这些電流能维持磁感線形成独立的磁圈。然而，在某些情况下這些電流會突然崩溃，从而允許磁場被重新連接到其他磁極，这个过程就叫 “磁重連”，在這個過程中會有許多能量以熱能和波動能的形式释放出來。太陽表面有數以百万計被磁化的小區域，而且不斷被米粒組織翻動着，日冕中的磁場就必須不斷地與這張 “磁性地毯” 進行 “重連” 操作，整体產生的熱能不容小觑。
然而，到目前為止，我們只知道這種加熱机制肯定與磁場有關，但沒有一种理論能非常理想地定量計算出日冕的高溫，最終的解決可能需要兩種甚至多種理論結合。這個谜题尚有待更多的觀察數據和更深入的思考來解決。