在生物出現至今的40多億年間，地球環境在不斷地變化著，時而酷熱，時而嚴寒，滄海變成高山，濕潤代替乾旱。在嚴酷的自然選擇的壓力下，大部分的種類不能適應這種變化被淘汰了，只有少部分種類的軀體結構在進化中變得複雜，變得對環境具有更強的適應性，並漸漸進化成新的類群，它們能更有效地利用環境資源，更多地留下後代。其實，在從古到今的漫長歲月中，物種的形成和滅絕從未停止過，只不過低等級的生物不會完全消失，也不會全部進化到結構更複雜的等級。所以在當今的世界上，既有低等的單細胞藻類植物，也有結構複雜的被子植物。
但必須要說明的是，進化是單方向、不可逆的，已經進化的物種不可能再回到祖先的形態。某種器官一經進化，不會在其後代中恢復原樣，也不會在其後代中重現。
現代的蕨類植物雖然和幾億年前的蕨類植物都屬於同一類群，但是器官構造都已經有了改變，而且現在的自然條件也不是當初種子植物出現時的狀況，所以現代的蕨類植物不可能進化成種子植物。